Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms