Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms