Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Lhx8O35652 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Lhx8O35652 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Sectm1b-207ENSMUST00000170381 1011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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