Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20939L7N243 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20939L7N243 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms