Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm6880A3KG45 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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