Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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