Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm10339-202ENSMUST00000181509 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Ccdc173-201ENSMUST00000094942 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 1700095A13Rik-201ENSMUST00000185460 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Ccdc153-206ENSMUST00000216632 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Olfr1512-201ENSMUST00000071221 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms