Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Pole3Q9JKP7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Pole3Q9JKP7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Pole3Q9JKP7 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Pole3Q9JKP7 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Pole3Q9JKP7 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms