Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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