Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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