Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Glns-ps1-201ENSMUST00000120291 1118 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm14407-201ENSMUST00000121260 447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm35298-201ENSMUST00000222719 430 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm8256-202ENSMUST00000227964 828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf17Q99MV7 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf17Q99MV7 Gm21818-202ENSMUST00000225144 894 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 H2afb2-201ENSMUST00000118616 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm37261-201ENSMUST00000194360 1101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 1700013G24Rik-201ENSMUST00000048893 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Mgst2-201ENSMUST00000099106 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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