Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ciao1Q99KN2 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ciao1Q99KN2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ciao1Q99KN2 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ciao1Q99KN2 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ciao1Q99KN2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ciao1Q99KN2 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ciao1Q99KN2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ciao1Q99KN2 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ciao1Q99KN2 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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