Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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