Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms