Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Zbtb37-205ENSMUST00000171748 2141 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc28bQ8CEG5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc28bQ8CEG5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc28bQ8CEG5 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc28bQ8CEG5 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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