Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms