Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Nsun3Q8CCT7 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nsun3Q8CCT7 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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