Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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