Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Dnm3-203ENSMUST00000159763 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 A530040E14Rik-201ENSMUST00000093501 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim35Q8C006 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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