Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms