Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms