Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pkp4Q68FH0 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pkp4Q68FH0 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pkp4Q68FH0 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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