Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Atg9aQ68FE2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Atg9aQ68FE2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Atg9aQ68FE2 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg9aQ68FE2 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg9aQ68FE2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg9aQ68FE2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg9aQ68FE2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg9aQ68FE2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg9aQ68FE2 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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