Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms