Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 AC153566.1-201ENSMUST00000216441 2057 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 5031425E22Rik-203ENSMUST00000188328 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 AC120406.1-201ENSMUST00000220362 482 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Nf1Q04690 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms