Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms