Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms