Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms