Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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