Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms