Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms