Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ms4a6c-201ENSMUST00000165310 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Brip1os-202ENSMUST00000143819 2604 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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