Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms