Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtpreP49446 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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