Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VdrP48281 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VdrP48281 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VdrP48281 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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