Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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SrprbP47758 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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SrprbP47758 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SrprbP47758 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms