Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5cP41230 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Kdm5cP41230 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Kdm5cP41230 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Kdm5cP41230 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Kdm5cP41230 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Kdm5cP41230 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5cP41230 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms