Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprkP35822 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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