Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cd28P31041 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cd28P31041 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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