Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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RxrgP28705 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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