Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RxraP28700 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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