Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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