Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P20040 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P20040 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P20040 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P20040 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P20040 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P20040 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P20040 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P20040 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P20040 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P20040 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P20040 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P20040 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P20040 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
P20040 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
P20040 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
P20040 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P20040 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P20040 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P20040 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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