Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Slc2a3-201ENSMUST00000032476 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms