Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Calb1P12658 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms