Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TtrP07309 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TtrP07309 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TtrP07309 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TtrP07309 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TtrP07309 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TtrP07309 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TtrP07309 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms