Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms