Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms