Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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