Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms